Понятие Судебный департамент при Верховном Суде Российской Федерации и его функции по организационному обеспечению деятельности судов общей юрисдикции и органов судейского сообщества впервые были введены Федеральным конституционным законом от 31 декабря 1996 года № 1-ФКЗ «О судебной системе Российской Федерации».

В январе 1998 года был принят Федеральный закон № 7-ФЗ «О Судебном департаменте при Верховном Суде Российской Федерации», и в этом же году были созданы его управления (отделы) в регионах. Управление Судебного департамента в Вологодской области начало свою работу 20 августа 1998 года.

Судебный департамент при Верховном Суде Российской Федерации, органы Судебного департамента в субъектах Российской Федерации, а также администраторы судов, ставшие «полномочными представителями» Судебного департамента в судебной системе, и созданное в 2012 году учреждение Судебного департамента (Федеральное государственное бюджетное учреждение «Информационно-аналитический центр поддержки ГАС «Правосудие») приняли на себя широкий круг обязанностей по организационному, информационному, кадровому, финансовому, материально-техническому обеспечению деятельности судов общей юрисдикции и тем самым освободили председателей судов от несвойственных им административно-хозяйственных функций.

Важнейшей нормой, закреплённой Федеральным законом от 8 января 1998 года № 7-ФЗ «О Судебном департаменте при Верховном Суде Российской Федерации», является положение статьи 4, согласно которой Судебный департамент, его органы и учреждения призваны способствовать укреплению самостоятельности судов, независимости судей и не вправе вмешиваться в осуществление правосудия.

Принцип невмешательства Судебного департамента в осуществление правосудия неукоснительно соблюдается в ходе организационного обеспечения деятельности судов.

Сегодня Судебный департамент стал реальным механизмом, решающим стратегические задачи по повышению доступности правосудия, обеспечению самостоятельности судов, претворяющим в жизнь принципиальные решения органов судейского сообщества.